種子(しゅし）の胚(はい）の幼根(ようこん）が発育して，まっすぐ下に向かってのびる根をいう。主根の回りには，多くの側根(そっこん）が出る。裸子(らし）植物と双子葉(そうしよう）植物の根の多くは，主根と側根(そっこん）よりなる。

 ダイコン・ニンジン・ゴボウなどは，主根が養分(ようぶん）をたくわえ，とくに太くなったもの。