種子(しゅし）^＊・花粉(かふん）・胞子(ほうし）・芽(め）などが成長(せいちょう）を始めることをいうが，ふつう発芽(はつが）といえば種子(しゅし）の場合をさす。発芽(はつが）は，温度・水・酸素(さんそ），種類(しゅるい）によっては光その他の条件(じょうけん）が満(み）たされたときにおきる。これらの条件(じょうけん）がそろっても，一定の休眠(きゅうみん）期間をすぎないと発芽(はつが）できないものもある。また，低温(ていおん）または高温にあわないと発芽(はつが）しないものなどもある。発芽(はつが）に必要(ひつよう）な養分(ようぶん）は，胚乳(はいにゅう）または子葉にふくまれている。この養分(ようぶん）を酵素(こうそ）が分解(ぶんかい）するときのエネルギーによって，胚(はい）の細胞分裂(さいぼうぶんれつ）が活発になる。

 発芽(はつが）の際(さい）は種子(しゅし）の細胞呼吸(さいぼうこきゅう）がさかんになるので，呼吸熱(こきゅうねつ）によって温度が上がる。